root/OpenSceneGraph/trunk/examples/osgvolume/osgvolume.cpp @ 9618

Revision 9618, 49.7 kB (checked in by robert, 5 years ago)

Refactored osg::TransferFunction?1D to use an std::map internally which is kept in sync with the actual osg::Image that is passed to the GPU.

Added .osg support for osg::TransferFunction?1D.

Updated wrappers

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
Line 
1/* OpenSceneGraph example, osgvolume.
2*
3*  Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
4*  of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
5*  in the Software without restriction, including without limitation the rights
6*  to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
7*  copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
8*  furnished to do so, subject to the following conditions:
9*
10*  THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
11*  IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
12*  FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
13*  AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
14*  LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
15*  OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
16*  THE SOFTWARE.
17*/
18
19#include <osg/Node>
20#include <osg/Geometry>
21#include <osg/Notify>
22#include <osg/Texture3D>
23#include <osg/Texture1D>
24#include <osg/ImageSequence>
25#include <osg/TexGen>
26#include <osg/Geode>
27#include <osg/Billboard>
28#include <osg/PositionAttitudeTransform>
29#include <osg/ClipNode>
30#include <osg/AlphaFunc>
31#include <osg/TexGenNode>
32#include <osg/TexEnv>
33#include <osg/TexEnvCombine>
34#include <osg/Material>
35#include <osg/PrimitiveSet>
36#include <osg/Endian>
37#include <osg/BlendFunc>
38#include <osg/BlendEquation>
39#include <osg/TransferFunction>
40#include <osg/MatrixTransform>
41
42#include <osgDB/Registry>
43#include <osgDB/ReadFile>
44#include <osgDB/WriteFile>
45#include <osgDB/FileUtils>
46#include <osgDB/FileNameUtils>
47
48#include <osgGA/EventVisitor>
49#include <osgGA/TrackballManipulator>
50#include <osgGA/FlightManipulator>
51#include <osgGA/KeySwitchMatrixManipulator>
52
53#include <osgUtil/CullVisitor>
54
55#include <osgViewer/Viewer>
56#include <osgViewer/ViewerEventHandlers>
57
58#include <osg/io_utils>
59
60#include <algorithm>
61#include <iostream>
62
63#include <osg/ImageUtils>
64#include <osgVolume/Volume>
65#include <osgVolume/VolumeTile>
66#include <osgVolume/RayTracedTechnique>
67#include <osgVolume/FixedFunctionTechnique>
68
69typedef std::vector< osg::ref_ptr<osg::Image> > ImageList;
70
71enum ShadingModel
72{
73    Standard,
74    Light,
75    Isosurface,
76    MaximumIntensityProjection
77};
78
79struct PassThroughTransformFunction
80{
81    unsigned char operator() (unsigned char c) const { return c; }
82};
83
84
85struct ProcessRow
86{
87    virtual ~ProcessRow() {}
88
89    virtual void operator() (unsigned int num,
90                    GLenum source_pixelFormat, unsigned char* source,
91                    GLenum dest_pixelFormat, unsigned char* dest) const 
92    {
93        switch(source_pixelFormat)
94        {
95        case(GL_LUMINANCE):
96        case(GL_ALPHA):
97            switch(dest_pixelFormat)
98            {
99            case(GL_LUMINANCE):
100            case(GL_ALPHA): A_to_A(num, source, dest); break;
101            case(GL_LUMINANCE_ALPHA): A_to_LA(num, source, dest); break;
102            case(GL_RGB): A_to_RGB(num, source, dest); break;
103            case(GL_RGBA): A_to_RGBA(num, source, dest); break;
104            }
105            break;
106        case(GL_LUMINANCE_ALPHA):
107            switch(dest_pixelFormat)
108            {
109            case(GL_LUMINANCE):
110            case(GL_ALPHA): LA_to_A(num, source, dest); break;
111            case(GL_LUMINANCE_ALPHA): LA_to_LA(num, source, dest); break;
112            case(GL_RGB): LA_to_RGB(num, source, dest); break;
113            case(GL_RGBA): LA_to_RGBA(num, source, dest); break;
114            }
115            break;
116        case(GL_RGB):
117            switch(dest_pixelFormat)
118            {
119            case(GL_LUMINANCE):
120            case(GL_ALPHA): RGB_to_A(num, source, dest); break;
121            case(GL_LUMINANCE_ALPHA): RGB_to_LA(num, source, dest); break;
122            case(GL_RGB): RGB_to_RGB(num, source, dest); break;
123            case(GL_RGBA): RGB_to_RGBA(num, source, dest); break;
124            }
125            break;
126        case(GL_RGBA):
127            switch(dest_pixelFormat)
128            {
129            case(GL_LUMINANCE):
130            case(GL_ALPHA): RGBA_to_A(num, source, dest); break;
131            case(GL_LUMINANCE_ALPHA): RGBA_to_LA(num, source, dest); break;
132            case(GL_RGB): RGBA_to_RGB(num, source, dest); break;
133            case(GL_RGBA): RGBA_to_RGBA(num, source, dest); break;
134            }
135            break;
136        }
137    }
138
139    ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
140    // alpha sources..   
141    virtual void A_to_A(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
142    {
143        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
144        {
145            *dest++ = *source++;
146        }
147    }
148
149    virtual void A_to_LA(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
150    {
151        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
152        {
153            *dest++ = *source;
154            *dest++ = *source++;
155        }
156    }
157                   
158    virtual void A_to_RGB(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
159    {
160        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
161        {
162            *dest++ = *source;
163            *dest++ = *source;
164            *dest++ = *source++;
165        }
166    }
167
168    virtual void A_to_RGBA(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
169    {
170        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
171        {
172            *dest++ = *source;
173            *dest++ = *source;
174            *dest++ = *source;
175            *dest++ = *source++;
176        }
177    }
178
179    ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
180    // alpha luminance sources..   
181    virtual void LA_to_A(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
182    {
183        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
184        {
185            ++source;
186            *dest++ = *source++;
187        }
188    }
189
190    virtual void LA_to_LA(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
191    {
192        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
193        {
194            *dest++ = *source++;
195            *dest++ = *source++;
196        }
197    }
198                   
199    virtual void LA_to_RGB(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
200    {
201        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
202        {
203            *dest++ = *source;
204            *dest++ = *source;
205            *dest++ = *source;
206            source+=2;
207        }
208    }
209
210    virtual void LA_to_RGBA(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
211    {
212        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
213        {
214            *dest++ = *source;
215            *dest++ = *source;
216            *dest++ = *source++;
217            *dest++ = *source++;
218        }
219    }
220
221    ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
222    // RGB sources..   
223    virtual void RGB_to_A(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
224    {
225        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
226        {
227            unsigned char val = *source;
228            *dest++ = val;
229            source += 3;
230        }
231    }
232
233    virtual void RGB_to_LA(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
234    {
235        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
236        {
237            unsigned char val = *source;
238            *dest++ = val;
239            *dest++ = val;
240            source += 3;
241        }
242    }
243                   
244    virtual void RGB_to_RGB(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
245    {
246        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
247        {
248            *dest++ = *source++;
249            *dest++ = *source++;
250            *dest++ = *source++;
251        }
252    }
253
254    virtual void RGB_to_RGBA(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
255    {
256        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
257        {
258            unsigned char val = *source;
259            *dest++ = *source++;
260            *dest++ = *source++;
261            *dest++ = *source++;
262            *dest++ = val;
263        }
264    }
265
266    ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
267    // RGBA sources..   
268    virtual void RGBA_to_A(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
269    {
270        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
271        {
272            source += 3;
273            *dest++ = *source++;
274        }
275    }
276
277    virtual void RGBA_to_LA(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
278    {
279        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
280        {
281            unsigned char val = *source;
282            source += 3;
283            *dest++ = val;
284            *dest++ = *source++;
285        }
286    }
287                   
288    virtual void RGBA_to_RGB(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
289    {
290        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
291        {
292            *dest++ = *source++;
293            *dest++ = *source++;
294            *dest++ = *source++;
295            ++source;
296        }
297    }
298
299    virtual void RGBA_to_RGBA(unsigned int num, unsigned char* source, unsigned char* dest) const
300    {
301        for(unsigned int i=0;i<num;++i)
302        {
303            *dest++ = *source++;
304            *dest++ = *source++;
305            *dest++ = *source++;
306            *dest++ = *source++;
307        }
308    }
309};
310
311
312void clampToNearestValidPowerOfTwo(int& sizeX, int& sizeY, int& sizeZ, int s_maximumTextureSize, int t_maximumTextureSize, int r_maximumTextureSize)
313{
314    // compute nearest powers of two for each axis.
315    int s_nearestPowerOfTwo = 1;
316    while(s_nearestPowerOfTwo<sizeX && s_nearestPowerOfTwo<s_maximumTextureSize) s_nearestPowerOfTwo*=2;
317
318    int t_nearestPowerOfTwo = 1;
319    while(t_nearestPowerOfTwo<sizeY && t_nearestPowerOfTwo<t_maximumTextureSize) t_nearestPowerOfTwo*=2;
320
321    int r_nearestPowerOfTwo = 1;
322    while(r_nearestPowerOfTwo<sizeZ && r_nearestPowerOfTwo<r_maximumTextureSize) r_nearestPowerOfTwo*=2;
323
324    sizeX = s_nearestPowerOfTwo;
325    sizeY = t_nearestPowerOfTwo;
326    sizeZ = r_nearestPowerOfTwo;
327}
328
329osg::Image* createTexture3D(ImageList& imageList, ProcessRow& processRow,
330            unsigned int numComponentsDesired,
331            int s_maximumTextureSize,
332            int t_maximumTextureSize,
333            int r_maximumTextureSize,
334            bool resizeToPowerOfTwo)
335{
336    int max_s = 0;
337    int max_t = 0;
338    unsigned int max_components = 0;
339    int total_r = 0;
340    ImageList::iterator itr;
341    for(itr=imageList.begin();
342        itr!=imageList.end();
343        ++itr)
344    {
345        osg::Image* image = itr->get();
346        GLenum pixelFormat = image->getPixelFormat();
347        if (pixelFormat==GL_ALPHA ||
348            pixelFormat==GL_INTENSITY ||
349            pixelFormat==GL_LUMINANCE ||
350            pixelFormat==GL_LUMINANCE_ALPHA ||
351            pixelFormat==GL_RGB ||
352            pixelFormat==GL_RGBA)
353        {
354            max_s = osg::maximum(image->s(), max_s);
355            max_t = osg::maximum(image->t(), max_t);
356            max_components = osg::maximum(osg::Image::computeNumComponents(pixelFormat), max_components);
357            total_r += image->r();
358        }
359        else
360        {
361            osg::notify(osg::NOTICE)<<"Image "<<image->getFileName()<<" has unsuitable pixel format"<< std::hex<< pixelFormat << std::dec << std::endl;
362        }
363    }
364   
365    if (numComponentsDesired!=0) max_components = numComponentsDesired;
366   
367    GLenum desiredPixelFormat = 0;
368    switch(max_components)
369    {
370    case(1):
371        osg::notify(osg::NOTICE)<<"desiredPixelFormat = GL_LUMINANCE" << std::endl;
372        desiredPixelFormat = GL_LUMINANCE;
373        break;
374    case(2):
375        osg::notify(osg::NOTICE)<<"desiredPixelFormat = GL_LUMINANCE_ALPHA" << std::endl;
376        desiredPixelFormat = GL_LUMINANCE_ALPHA;
377        break;
378    case(3):
379        osg::notify(osg::NOTICE)<<"desiredPixelFormat = GL_RGB" << std::endl;
380        desiredPixelFormat = GL_RGB;
381        break;
382    case(4):
383        osg::notify(osg::NOTICE)<<"desiredPixelFormat = GL_RGBA" << std::endl;
384        desiredPixelFormat = GL_RGBA;
385        break;
386    }   
387    if (desiredPixelFormat==0) return 0;
388   
389    // compute nearest powers of two for each axis.
390   
391    int s_nearestPowerOfTwo = 1;
392    int t_nearestPowerOfTwo = 1;
393    int r_nearestPowerOfTwo = 1;
394
395    if (resizeToPowerOfTwo)
396    {
397        while(s_nearestPowerOfTwo<max_s && s_nearestPowerOfTwo<s_maximumTextureSize) s_nearestPowerOfTwo*=2;
398        while(t_nearestPowerOfTwo<max_t && t_nearestPowerOfTwo<t_maximumTextureSize) t_nearestPowerOfTwo*=2;
399        while(r_nearestPowerOfTwo<total_r && r_nearestPowerOfTwo<r_maximumTextureSize) r_nearestPowerOfTwo*=2;
400
401        osg::notify(osg::NOTICE)<<"max image width = "<<max_s<<"  nearest power of two = "<<s_nearestPowerOfTwo<<std::endl;
402        osg::notify(osg::NOTICE)<<"max image height = "<<max_t<<"  nearest power of two = "<<t_nearestPowerOfTwo<<std::endl;
403        osg::notify(osg::NOTICE)<<"max image depth = "<<total_r<<"  nearest power of two = "<<r_nearestPowerOfTwo<<std::endl;
404    }
405    else
406    {
407        s_nearestPowerOfTwo = max_s;
408        t_nearestPowerOfTwo = max_t;
409        r_nearestPowerOfTwo = total_r;
410    }
411   
412    // now allocate the 3d texture;
413    osg::ref_ptr<osg::Image> image_3d = new osg::Image;
414    image_3d->allocateImage(s_nearestPowerOfTwo,t_nearestPowerOfTwo,r_nearestPowerOfTwo,
415                            desiredPixelFormat,GL_UNSIGNED_BYTE);
416       
417
418    unsigned int r_offset = (total_r<r_nearestPowerOfTwo) ? r_nearestPowerOfTwo/2 - total_r/2 : 0;
419
420    int curr_dest_r = r_offset;
421
422    // copy across the values from the source images into the image_3d.
423    for(itr=imageList.begin();
424        itr!=imageList.end();
425        ++itr)
426    {
427        osg::Image* image = itr->get();
428        GLenum pixelFormat = image->getPixelFormat();
429        if (pixelFormat==GL_ALPHA ||
430            pixelFormat==GL_LUMINANCE ||
431            pixelFormat==GL_INTENSITY ||
432            pixelFormat==GL_LUMINANCE_ALPHA ||
433            pixelFormat==GL_RGB ||
434            pixelFormat==GL_RGBA)
435        {
436       
437            int num_r = osg::minimum(image->r(), (image_3d->r() - curr_dest_r));
438            int num_t = osg::minimum(image->t(), image_3d->t());
439            int num_s = osg::minimum(image->s(), image_3d->s());
440       
441            unsigned int s_offset_dest = (image->s()<s_nearestPowerOfTwo) ? s_nearestPowerOfTwo/2 - image->s()/2 : 0;
442            unsigned int t_offset_dest = (image->t()<t_nearestPowerOfTwo) ? t_nearestPowerOfTwo/2 - image->t()/2 : 0;
443
444            for(int r=0;r<num_r;++r, ++curr_dest_r)
445            {
446                for(int t=0;t<num_t;++t)
447                {
448                    unsigned char* dest = image_3d->data(s_offset_dest,t+t_offset_dest,curr_dest_r);
449                    unsigned char* source = image->data(0,t,r);
450
451                    processRow(num_s, image->getPixelFormat(), source, image_3d->getPixelFormat(), dest);
452                }
453            }
454        }
455    }
456    return image_3d.release();
457}
458
459
460struct ScaleOperator
461{
462    ScaleOperator():_scale(1.0f) {}
463    ScaleOperator(float scale):_scale(scale) {}
464    ScaleOperator(const ScaleOperator& so):_scale(so._scale) {}
465   
466    ScaleOperator& operator = (const ScaleOperator& so) { _scale = so._scale; return *this; }
467
468    float _scale;
469
470    inline void luminance(float& l) const { l*= _scale; }
471    inline void alpha(float& a) const { a*= _scale; }
472    inline void luminance_alpha(float& l,float& a) const { l*= _scale; a*= _scale;  }
473    inline void rgb(float& r,float& g,float& b) const { r*= _scale; g*=_scale; b*=_scale; }
474    inline void rgba(float& r,float& g,float& b,float& a) const { r*= _scale; g*=_scale; b*=_scale; a*=_scale; }
475};
476
477struct RecordRowOperator
478{
479    RecordRowOperator(unsigned int num):_colours(num),_pos(0) {}
480
481    mutable std::vector<osg::Vec4>  _colours;
482    mutable unsigned int            _pos;
483   
484    inline void luminance(float l) const { rgba(l,l,l,1.0f); }
485    inline void alpha(float a) const { rgba(1.0f,1.0f,1.0f,a); }
486    inline void luminance_alpha(float l,float a) const { rgba(l,l,l,a);  }
487    inline void rgb(float r,float g,float b) const { rgba(r,g,b,1.0f); }
488    inline void rgba(float r,float g,float b,float a) const { _colours[_pos++].set(r,g,b,a); }
489};
490
491struct WriteRowOperator
492{
493    WriteRowOperator():_pos(0) {}
494    WriteRowOperator(unsigned int num):_colours(num),_pos(0) {}
495
496    std::vector<osg::Vec4>  _colours;
497    mutable unsigned int    _pos;
498   
499    inline void luminance(float& l) const { l = _colours[_pos++].r(); }
500    inline void alpha(float& a) const { a = _colours[_pos++].a(); }
501    inline void luminance_alpha(float& l,float& a) const { l = _colours[_pos].r(); a = _colours[_pos++].a(); }
502    inline void rgb(float& r,float& g,float& b) const { r = _colours[_pos].r(); g = _colours[_pos].g(); b = _colours[_pos].b(); }
503    inline void rgba(float& r,float& g,float& b,float& a) const {  r = _colours[_pos].r(); g = _colours[_pos].g(); b = _colours[_pos].b(); a = _colours[_pos++].a(); }
504};
505
506osg::Image* readRaw(int sizeX, int sizeY, int sizeZ, int numberBytesPerComponent, int numberOfComponents, const std::string& endian, const std::string& raw_filename)
507{
508    osgDB::ifstream fin(raw_filename.c_str(), std::ifstream::binary);
509    if (!fin) return 0;
510
511    GLenum pixelFormat;
512    switch(numberOfComponents)
513    {
514        case 1 : pixelFormat = GL_LUMINANCE; break;
515        case 2 : pixelFormat = GL_LUMINANCE_ALPHA; break;
516        case 3 : pixelFormat = GL_RGB; break;
517        case 4 : pixelFormat = GL_RGBA; break;
518        default :
519            osg::notify(osg::NOTICE)<<"Error: numberOfComponents="<<numberOfComponents<<" not supported, only 1,2,3 or 4 are supported."<<std::endl;
520            return 0;
521    }
522
523   
524    GLenum dataType;
525    switch(numberBytesPerComponent)
526    {
527        case 1 : dataType = GL_UNSIGNED_BYTE; break;
528        case 2 : dataType = GL_UNSIGNED_SHORT; break;
529        case 4 : dataType = GL_UNSIGNED_INT; break;
530        default :
531            osg::notify(osg::NOTICE)<<"Error: numberBytesPerComponent="<<numberBytesPerComponent<<" not supported, only 1,2 or 4 are supported."<<std::endl;
532            return 0;
533    }
534   
535    int s_maximumTextureSize=256, t_maximumTextureSize=256, r_maximumTextureSize=256;
536   
537    int sizeS = sizeX;
538    int sizeT = sizeY;
539    int sizeR = sizeZ;
540    clampToNearestValidPowerOfTwo(sizeS, sizeT, sizeR, s_maximumTextureSize, t_maximumTextureSize, r_maximumTextureSize);
541
542    osg::ref_ptr<osg::Image> image = new osg::Image;
543    image->allocateImage(sizeS, sizeT, sizeR, pixelFormat, dataType);
544   
545   
546    bool endianSwap = (osg::getCpuByteOrder()==osg::BigEndian) ? (endian!="big") : (endian=="big");
547   
548    unsigned int r_offset = (sizeZ<sizeR) ? sizeR/2 - sizeZ/2 : 0;
549   
550    int offset = endianSwap ? numberBytesPerComponent : 0;
551    int delta = endianSwap ? -1 : 1;
552    for(int r=0;r<sizeZ;++r)
553    {
554        for(int t=0;t<sizeY;++t)
555        {
556            char* data = (char*) image->data(0,t,r+r_offset);
557            for(int s=0;s<sizeX;++s)
558            {
559                if (!fin) return 0;
560               
561                for(int c=0;c<numberOfComponents;++c)
562                {
563                    char* ptr = data+offset;
564                    for(int b=0;b<numberBytesPerComponent;++b)
565                    {
566                        fin.read((char*)ptr, 1);
567                        ptr += delta;
568                    }
569                    data += numberBytesPerComponent;
570                }
571            }
572        }
573    }
574
575
576    // normalise texture
577    {
578        // compute range of values
579        osg::Vec4 minValue, maxValue;
580        osg::computeMinMax(image.get(), minValue, maxValue);
581        osg::modifyImage(image.get(),ScaleOperator(1.0f/maxValue.r()));
582    }
583   
584   
585    fin.close();
586
587    if (dataType!=GL_UNSIGNED_BYTE)
588    {
589        // need to convert to ubyte
590       
591        osg::ref_ptr<osg::Image> new_image = new osg::Image;
592        new_image->allocateImage(sizeS, sizeT, sizeR, pixelFormat, GL_UNSIGNED_BYTE);
593       
594        RecordRowOperator readOp(sizeS);
595        WriteRowOperator writeOp;
596
597        for(int r=0;r<sizeR;++r)
598        {
599            for(int t=0;t<sizeT;++t)
600            {
601                // reset the indices to beginning
602                readOp._pos = 0;
603                writeOp._pos = 0;
604           
605                // read the pixels into readOp's _colour array
606                osg::readRow(sizeS, pixelFormat, dataType, image->data(0,t,r), readOp);
607                               
608                // pass readOp's _colour array contents over to writeOp (note this is just a pointer swap).
609                writeOp._colours.swap(readOp._colours);
610               
611                osg::modifyRow(sizeS, pixelFormat, GL_UNSIGNED_BYTE, new_image->data(0,t,r), writeOp);
612
613                // return readOp's _colour array contents back to its rightful owner.
614                writeOp._colours.swap(readOp._colours);
615            }
616        }
617       
618        image = new_image;
619    }
620   
621    return image.release();
622   
623   
624}
625
626enum ColourSpaceOperation
627{
628    NO_COLOUR_SPACE_OPERATION,
629    MODULATE_ALPHA_BY_LUMINANCE,
630    MODULATE_ALPHA_BY_COLOUR,
631    REPLACE_ALPHA_WITH_LUMINANACE,
632    REPLACE_RGB_WITH_LUMINANCE
633};
634
635struct ModulateAlphaByLuminanceOperator
636{
637    ModulateAlphaByLuminanceOperator() {}
638
639    inline void luminance(float&) const {}
640    inline void alpha(float&) const {}
641    inline void luminance_alpha(float& l,float& a) const { a*= l; }
642    inline void rgb(float&,float&,float&) const {}
643    inline void rgba(float& r,float& g,float& b,float& a) const { float l = (r+g+b)*0.3333333; a *= l;}
644};
645
646struct ModulateAlphaByColourOperator
647{
648    ModulateAlphaByColourOperator(const osg::Vec4& colour):_colour(colour) { _lum = _colour.length(); }
649   
650    osg::Vec4 _colour;
651    float _lum;
652
653    inline void luminance(float&) const {}
654    inline void alpha(float&) const {}
655    inline void luminance_alpha(float& l,float& a) const { a*= l*_lum; }
656    inline void rgb(float&,float&,float&) const {}
657    inline void rgba(float& r,float& g,float& b,float& a) const { a = (r*_colour.r()+g*_colour.g()+b*_colour.b()+a*_colour.a()); }
658};
659
660struct ReplaceAlphaWithLuminanceOperator
661{
662    ReplaceAlphaWithLuminanceOperator() {}
663
664    inline void luminance(float&) const {}
665    inline void alpha(float&) const {}
666    inline void luminance_alpha(float& l,float& a) const { a= l; }
667    inline void rgb(float&,float&,float&) const { }
668    inline void rgba(float& r,float& g,float& b,float& a) const { float l = (r+g+b)*0.3333333; a = l; }
669};
670
671osg::Image* doColourSpaceConversion(ColourSpaceOperation op, osg::Image* image, osg::Vec4& colour)
672{
673    switch(op)
674    {
675        case (MODULATE_ALPHA_BY_LUMINANCE):
676        {
677            std::cout<<"doing conversion MODULATE_ALPHA_BY_LUMINANCE"<<std::endl;
678            osg::modifyImage(image,ModulateAlphaByLuminanceOperator());
679            return image;
680        }
681        case (MODULATE_ALPHA_BY_COLOUR):
682        {
683            std::cout<<"doing conversion MODULATE_ALPHA_BY_COLOUR"<<std::endl;
684            osg::modifyImage(image,ModulateAlphaByColourOperator(colour));
685            return image;
686        }
687        case (REPLACE_ALPHA_WITH_LUMINANACE):
688        {
689            std::cout<<"doing conversion REPLACE_ALPHA_WITH_LUMINANACE"<<std::endl;
690            osg::modifyImage(image,ReplaceAlphaWithLuminanceOperator());
691            return image;
692        }
693        case (REPLACE_RGB_WITH_LUMINANCE):
694        {
695            std::cout<<"doing conversion REPLACE_ALPHA_WITH_LUMINANACE"<<std::endl;
696            osg::Image* newImage = new osg::Image;
697            newImage->allocateImage(image->s(), image->t(), image->r(), GL_LUMINANCE, image->getDataType());
698            osg::copyImage(image, 0, 0, 0, image->s(), image->t(), image->r(),
699                           newImage, 0, 0, 0, false);
700            return newImage;
701        }
702        default:
703            return image;
704    }
705}
706
707
708osg::TransferFunction1D* readTransferFunctionFile(const std::string& filename)
709{
710    std::string foundFile = osgDB::findDataFile(filename);
711    if (foundFile.empty())
712    {
713        std::cout<<"Error: could not find transfer function file : "<<filename<<std::endl;
714        return 0;
715    }
716   
717    std::cout<<"Reading transfer function "<<filename<<std::endl;
718
719    osg::TransferFunction1D::ColorMap colorMap;
720    osgDB::ifstream fin(foundFile.c_str());
721    while(fin)
722    {
723        float value, red, green, blue, alpha;
724        fin >> value >> red >> green >> blue >> alpha;
725        if (fin)
726        {
727            std::cout<<"value = "<<value<<" ("<<red<<", "<<green<<", "<<blue<<", "<<alpha<<")"<<std::endl;
728            colorMap[value] = osg::Vec4(red,green,blue,alpha);
729        }
730    }
731   
732    if (colorMap.empty())
733    {
734        std::cout<<"Error: No values read from transfer function file: "<<filename<<std::endl;
735        return 0;
736    }
737   
738    osg::TransferFunction1D* tf = new osg::TransferFunction1D;
739    tf->assign(colorMap);
740   
741    return tf;
742}
743
744
745class TestSupportOperation: public osg::GraphicsOperation
746{
747public:
748
749    TestSupportOperation():
750        osg::GraphicsOperation("TestSupportOperation",false),
751        supported(true),
752        errorMessage(),
753        maximumTextureSize(256) {}
754
755    virtual void operator () (osg::GraphicsContext* gc)
756    {
757        OpenThreads::ScopedLock<OpenThreads::Mutex> lock(mutex);
758
759        glGetIntegerv( GL_MAX_3D_TEXTURE_SIZE, &maximumTextureSize );
760       
761        osg::notify(osg::NOTICE)<<"Max texture size="<<maximumTextureSize<<std::endl;
762    }
763       
764    OpenThreads::Mutex  mutex;
765    bool                supported;
766    std::string         errorMessage;
767    GLint               maximumTextureSize;
768};
769
770
771
772int main( int argc, char **argv )
773{
774    // use an ArgumentParser object to manage the program arguments.
775    osg::ArgumentParser arguments(&argc,argv);
776   
777    // set up the usage document, in case we need to print out how to use this program.
778    arguments.getApplicationUsage()->setDescription(arguments.getApplicationName()+" is the example which demonstrates use of 3D textures.");
779    arguments.getApplicationUsage()->setCommandLineUsage(arguments.getApplicationName()+" [options] filename ...");
780    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("-h or --help","Display this information");
781    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("-s <numSlices>","Number of slices to create.");
782    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--images [filenames]","Specify a stack of 2d images to build the 3d volume from.");
783    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--shader","Use OpenGL Shading Language. (default)");
784    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--no-shader","Disable use of OpenGL Shading Language.");
785    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--gpu-tf","Aply the transfer function on the GPU. (default)");
786    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--cpu-tf","Apply the transfer function on the CPU.");
787    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--mip","Use Maximum Intensity Projection (MIP) filtering.");
788    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--xSize <size>","Relative width of rendered brick.");
789    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--ySize <size>","Relative length of rendered brick.");
790    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--zSize <size>","Relative height of rendered brick.");
791    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--xMultiplier <multiplier>","Tex coord x mulitplier.");
792    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--yMultiplier <multiplier>","Tex coord y mulitplier.");
793    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--zMultiplier <multiplier>","Tex coord z mulitplier.");
794    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--clip <ratio>","clip volume as a ratio, 0.0 clip all, 1.0 clip none.");
795    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--maxTextureSize <size>","Set the texture maximum resolution in the s,t,r (x,y,z) dimensions.");
796    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--s_maxTextureSize <size>","Set the texture maximum resolution in the s (x) dimension.");
797    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--t_maxTextureSize <size>","Set the texture maximum resolution in the t (y) dimension.");
798    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--r_maxTextureSize <size>","Set the texture maximum resolution in the r (z) dimension.");
799    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--compressed","Enable the usage of compressed textures.");
800    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--compressed-arb","Enable the usage of OpenGL ARB compressed textures.");
801    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--compressed-dxt1","Enable the usage of S3TC DXT1 compressed textures.");
802    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--compressed-dxt3","Enable the usage of S3TC DXT3 compressed textures.");
803    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--compressed-dxt5","Enable the usage of S3TC DXT5 compressed textures.");
804    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--modulate-alpha-by-luminance","For each pixel multiply the alpha value by the luminance.");
805    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--replace-alpha-with-luminance","For each pixel set the alpha value to the luminance.");
806    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--replace-rgb-with-luminance","For each rgb pixel convert to the luminance.");
807    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--num-components <num>","Set the number of components to in he target image.");
808    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--no-rescale","Disable the rescaling of the pixel data to 0.0 to 1.0 range");
809    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--rescale","Enable the rescale of the pixel data to 0.0 to 1.0 range (default).");
810    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--shift-min-to-zero","Shift the pixel data so min value is 0.0.");
811//    arguments.getApplicationUsage()->addCommandLineOption("--raw <sizeX> <sizeY> <sizeZ> <numberBytesPerComponent> <numberOfComponents> <endian> <filename>","read a raw image data");
812
813    // construct the viewer.
814    osgViewer::Viewer viewer(arguments);
815
816    // add the window size toggle handler
817    viewer.addEventHandler(new osgViewer::WindowSizeHandler);
818       
819    {
820        osg::ref_ptr<osgGA::KeySwitchMatrixManipulator> keyswitchManipulator = new osgGA::KeySwitchMatrixManipulator;
821
822        keyswitchManipulator->addMatrixManipulator( '1', "Trackball", new osgGA::TrackballManipulator() );
823       
824        osgGA::FlightManipulator* flightManipulator = new osgGA::FlightManipulator();
825        flightManipulator->setYawControlMode(osgGA::FlightManipulator::NO_AUTOMATIC_YAW);
826        keyswitchManipulator->addMatrixManipulator( '2', "Flight", flightManipulator );
827
828        viewer.setCameraManipulator( keyswitchManipulator.get() );
829    }
830
831    // add the stats handler
832    viewer.addEventHandler(new osgViewer::StatsHandler);
833
834    viewer.getCamera()->setClearColor(osg::Vec4(0.0f,0.0f,0.0f,0.0f));
835
836    // if user request help write it out to cout.
837    if (arguments.read("-h") || arguments.read("--help"))
838    {
839        arguments.getApplicationUsage()->write(std::cout);
840        return 1;
841    }
842
843    std::string outputFile;
844    while (arguments.read("-o",outputFile)) {}
845
846
847
848    osg::ref_ptr<osg::TransferFunction1D> transferFunction;
849    std::string tranferFunctionFile;
850    while (arguments.read("--tf",tranferFunctionFile))
851    {
852        transferFunction = readTransferFunctionFile(tranferFunctionFile);
853    }
854   
855    while(arguments.read("--test"))
856    {
857        transferFunction = new osg::TransferFunction1D;
858        transferFunction->setColor(0.0, osg::Vec4(1.0,0.0,0.0,0.0));
859        transferFunction->setColor(0.5, osg::Vec4(1.0,1.0,0.0,0.5));
860        transferFunction->setColor(1.0, osg::Vec4(0.0,0.0,1.0,1.0));
861    }
862
863    while(arguments.read("--test2"))
864    {
865        transferFunction = new osg::TransferFunction1D;
866        transferFunction->setColor(0.0, osg::Vec4(1.0,0.0,0.0,0.0));
867        transferFunction->setColor(0.5, osg::Vec4(1.0,1.0,0.0,0.5));
868        transferFunction->setColor(1.0, osg::Vec4(0.0,0.0,1.0,1.0));
869        transferFunction->assign(transferFunction->getColorMap());
870    }
871
872    unsigned int numSlices=500;
873    while (arguments.read("-s",numSlices)) {}
874   
875   
876    float sliceEnd=1.0f;
877    while (arguments.read("--clip",sliceEnd)) {}
878
879    float alphaFunc=0.02f;
880    while (arguments.read("--alphaFunc",alphaFunc)) {}
881
882
883   
884    ShadingModel shadingModel = Standard;
885    while(arguments.read("--mip")) shadingModel =  MaximumIntensityProjection;
886
887    while (arguments.read("--isosurface")) shadingModel = Isosurface;
888
889    while (arguments.read("--light")) shadingModel = Light;
890
891    float xSize=1.0f, ySize=1.0f, zSize=1.0f;
892    while (arguments.read("--xSize",xSize)) {}
893    while (arguments.read("--ySize",ySize)) {}
894    while (arguments.read("--zSize",zSize)) {}
895
896    float xMultiplier=1.0f, yMultiplier=1.0f, zMultiplier=1.0f;
897    while (arguments.read("--xMultiplier",xMultiplier)) {}
898    while (arguments.read("--yMultiplier",yMultiplier)) {}
899    while (arguments.read("--zMultiplier",zMultiplier)) {}
900
901    osg::ref_ptr<TestSupportOperation> testSupportOperation = new TestSupportOperation;
902    viewer.setRealizeOperation(testSupportOperation.get());
903   
904    viewer.realize();
905
906    int maximumTextureSize = testSupportOperation->maximumTextureSize;
907    int s_maximumTextureSize = maximumTextureSize;
908    int t_maximumTextureSize = maximumTextureSize;
909    int r_maximumTextureSize = maximumTextureSize;
910    while(arguments.read("--maxTextureSize",maximumTextureSize))
911    {
912        s_maximumTextureSize = maximumTextureSize;
913        t_maximumTextureSize = maximumTextureSize;
914        r_maximumTextureSize = maximumTextureSize;
915    }
916    while(arguments.read("--s_maxTextureSize",s_maximumTextureSize)) {}
917    while(arguments.read("--t_maxTextureSize",t_maximumTextureSize)) {}
918    while(arguments.read("--r_maxTextureSize",r_maximumTextureSize)) {}
919
920    osg::Texture::InternalFormatMode internalFormatMode = osg::Texture::USE_IMAGE_DATA_FORMAT;
921    while(arguments.read("--compressed") || arguments.read("--compressed-arb")) { internalFormatMode = osg::Texture::USE_ARB_COMPRESSION; }
922
923    while(arguments.read("--compressed-dxt1")) { internalFormatMode = osg::Texture::USE_S3TC_DXT1_COMPRESSION; }
924    while(arguments.read("--compressed-dxt3")) { internalFormatMode = osg::Texture::USE_S3TC_DXT3_COMPRESSION; }
925    while(arguments.read("--compressed-dxt5")) { internalFormatMode = osg::Texture::USE_S3TC_DXT5_COMPRESSION; }
926   
927   
928    // set up colour space operation.
929    ColourSpaceOperation colourSpaceOperation = NO_COLOUR_SPACE_OPERATION;
930    osg::Vec4 colourModulate(0.25f,0.25f,0.25f,0.25f);
931    while(arguments.read("--modulate-alpha-by-luminance")) { colourSpaceOperation = MODULATE_ALPHA_BY_LUMINANCE; }
932    while(arguments.read("--modulate-alpha-by-colour", colourModulate.x(),colourModulate.y(),colourModulate.z(),colourModulate.w() )) { colourSpaceOperation = MODULATE_ALPHA_BY_COLOUR; }
933    while(arguments.read("--replace-alpha-with-luminance")) { colourSpaceOperation = REPLACE_ALPHA_WITH_LUMINANACE; }
934    while(arguments.read("--replace-rgb-with-luminance")) { colourSpaceOperation = REPLACE_RGB_WITH_LUMINANCE; }
935
936
937    enum RescaleOperation
938    {
939        NO_RESCALE,
940        RESCALE_TO_ZERO_TO_ONE_RANGE,
941        SHIFT_MIN_TO_ZERO
942    };
943   
944    RescaleOperation rescaleOperation = RESCALE_TO_ZERO_TO_ONE_RANGE;
945    while(arguments.read("--no-rescale")) rescaleOperation = NO_RESCALE;
946    while(arguments.read("--rescale")) rescaleOperation = RESCALE_TO_ZERO_TO_ONE_RANGE;
947    while(arguments.read("--shift-min-to-zero")) rescaleOperation = SHIFT_MIN_TO_ZERO;
948
949       
950    bool resizeToPowerOfTwo = false;
951   
952    unsigned int numComponentsDesired = 0;
953    while(arguments.read("--num-components", numComponentsDesired)) {}
954
955    bool useShader = true;
956    while(arguments.read("--shader")) { useShader = true; }
957    while(arguments.read("--no-shader")) { useShader = false; }
958
959    bool gpuTransferFunction = true;
960    while(arguments.read("--gpu-tf")) { gpuTransferFunction = true; }
961    while(arguments.read("--cpu-tf")) { gpuTransferFunction = false; }
962
963    typedef std::list< osg::ref_ptr<osg::Image> > Images;
964    Images images;
965
966
967    std::string vh_filename;
968    while (arguments.read("--vh", vh_filename))
969    {
970        std::string raw_filename, transfer_filename;
971        int xdim(0), ydim(0), zdim(0);
972
973        osgDB::ifstream header(vh_filename.c_str());
974        if (header)
975        {
976            header >> raw_filename >> transfer_filename >> xdim >> ydim >> zdim >> xSize >> ySize >> zSize;
977        }
978       
979        if (xdim*ydim*zdim==0)
980        {
981            std::cout<<"Error in reading volume header "<<vh_filename<<std::endl;
982            return 1;
983        }
984       
985        if (!raw_filename.empty())
986        {
987            images.push_back(readRaw(xdim, ydim, zdim, 1, 1, "little", raw_filename));
988        }
989       
990        if (!transfer_filename.empty())
991        {
992            osgDB::ifstream fin(transfer_filename.c_str());
993            if (fin)
994            {
995                osg::TransferFunction1D::ColorMap colorMap;
996                float value = 0.0;
997                while(fin && value<=1.0)
998                {
999                    float red, green, blue, alpha;
1000                    fin >> red >> green >> blue >> alpha;
1001                    if (fin)
1002                    {
1003                        colorMap[value] = osg::Vec4(red/255.0f,green/255.0f,blue/255.0f,alpha/255.0f);
1004                        std::cout<<"value = "<<value<<" ("<<red<<", "<<green<<", "<<blue<<", "<<alpha<<")";
1005                        std::cout<<"  ("<<colorMap[value]<<")"<<std::endl;
1006                    }
1007                    value += 1/255.0;
1008                }
1009
1010                if (colorMap.empty())
1011                {
1012                    std::cout<<"Error: No values read from transfer function file: "<<transfer_filename<<std::endl;
1013                    return 0;
1014                }
1015
1016                transferFunction = new osg::TransferFunction1D;
1017                transferFunction->assign(colorMap);
1018            }
1019        }
1020
1021    }
1022   
1023
1024    int sizeX, sizeY, sizeZ, numberBytesPerComponent, numberOfComponents;
1025    std::string endian, raw_filename;
1026    while (arguments.read("--raw", sizeX, sizeY, sizeZ, numberBytesPerComponent, numberOfComponents, endian, raw_filename))
1027    {
1028        images.push_back(readRaw(sizeX, sizeY, sizeZ, numberBytesPerComponent, numberOfComponents, endian, raw_filename));
1029    }
1030
1031    int images_pos = arguments.find("--images");
1032    if (images_pos>=0)
1033    {
1034        ImageList imageList;
1035        int pos=images_pos+1;
1036        for(;pos<arguments.argc() && !arguments.isOption(pos);++pos)
1037        {
1038            // not an option so assume string is a filename.
1039            osg::Image *image = osgDB::readImageFile( arguments[pos]);
1040
1041            if(image)
1042            {
1043                imageList.push_back(image);
1044            }
1045        }
1046       
1047        arguments.remove(images_pos, pos-images_pos);
1048       
1049        // pack the textures into a single texture.
1050        ProcessRow processRow;
1051        images.push_back(createTexture3D(imageList, processRow, numComponentsDesired, s_maximumTextureSize, t_maximumTextureSize, r_maximumTextureSize, resizeToPowerOfTwo));
1052    }
1053
1054
1055    // any option left unread are converted into errors to write out later.
1056    arguments.reportRemainingOptionsAsUnrecognized();
1057
1058    // report any errors if they have occurred when parsing the program arguments.
1059    if (arguments.errors())
1060    {
1061        arguments.writeErrorMessages(std::cout);
1062        return 1;
1063    }
1064   
1065
1066    // assume remaining arguments are file names of textures.
1067    for(int pos=1;pos<arguments.argc();++pos)
1068    {
1069        if (!arguments.isOption(pos))
1070        {
1071            std::string filename = arguments[pos];
1072            if (osgDB::getLowerCaseFileExtension(filename)=="dicom")
1073            {
1074                // not an option so assume string is a filename.
1075                osg::Image *image = osgDB::readImageFile(filename);
1076                if(image)
1077                {
1078                    images.push_back(image);
1079                }
1080            }
1081            else
1082            {
1083                osgDB::FileType fileType = osgDB::fileType(filename);
1084                if (fileType == osgDB::FILE_NOT_FOUND)
1085                {
1086                    filename = osgDB::findDataFile(filename);
1087                    fileType = osgDB::fileType(filename);
1088                }
1089
1090                if (fileType == osgDB::DIRECTORY)
1091                {
1092                   osg::Image *image = osgDB::readImageFile(filename+".dicom");
1093                    if(image)
1094                    {
1095                        images.push_back(image);
1096                    }
1097                }
1098                else if (fileType == osgDB::REGULAR_FILE)
1099                {
1100                    // not an option so assume string is a filename.
1101                    images.push_back(osgDB::readImageFile( filename ));
1102                }
1103                else
1104                {
1105                    osg::notify(osg::NOTICE)<<"Error: could not find file: "<<filename<<std::endl;
1106                    return 1;
1107                }
1108            }           
1109        }
1110    }
1111   
1112    if (images.empty())
1113    {
1114        std::cout<<"No model loaded, please specify and volumetric image file on the command line."<<std::endl;
1115        return 1;
1116    }
1117
1118
1119    Images::iterator sizeItr = images.begin();
1120    xSize = (*sizeItr)->s();
1121    ySize = (*sizeItr)->t();
1122    zSize = (*sizeItr)->r();
1123    ++sizeItr;
1124
1125    for(;sizeItr != images.end(); ++sizeItr)
1126    {
1127        if ((*sizeItr)->s() != xSize ||
1128            (*sizeItr)->t() != ySize ||
1129            (*sizeItr)->r() != zSize)
1130        {
1131            std::cout<<"Images in sequence are not of the same dimensions."<<std::endl;
1132            return 1;
1133        }
1134    }
1135
1136
1137    osg::RefMatrix* matrix = dynamic_cast<osg::RefMatrix*>(images.front()->getUserData());
1138
1139    osg::Vec4 minValue(FLT_MAX, FLT_MAX, FLT_MAX, FLT_MAX);
1140    osg::Vec4 maxValue(-FLT_MAX, -FLT_MAX, -FLT_MAX, -FLT_MAX);
1141    bool computeMinMax = false;
1142    for(Images::iterator itr = images.begin();
1143        itr != images.end();
1144        ++itr)
1145    {
1146        osg::Vec4 localMinValue, localMaxValue;
1147        if (osg::computeMinMax(itr->get(), localMinValue, localMaxValue))
1148        {
1149            if (localMinValue.r()<minValue.r()) minValue.r() = localMinValue.r();
1150            if (localMinValue.g()<minValue.g()) minValue.g() = localMinValue.g();
1151            if (localMinValue.b()<minValue.b()) minValue.b() = localMinValue.b();
1152            if (localMinValue.a()<minValue.a()) minValue.a() = localMinValue.a();
1153
1154            if (localMaxValue.r()>maxValue.r()) maxValue.r() = localMaxValue.r();
1155            if (localMaxValue.g()>maxValue.g()) maxValue.g() = localMaxValue.g();
1156            if (localMaxValue.b()>maxValue.b()) maxValue.b() = localMaxValue.b();
1157            if (localMaxValue.a()>maxValue.a()) maxValue.a() = localMaxValue.a();
1158
1159            osg::notify(osg::NOTICE)<<"  ("<<localMinValue<<") ("<<localMaxValue<<") "<<(*itr)->getFileName()<<std::endl;
1160
1161            computeMinMax = true;
1162        }
1163    }
1164   
1165    if (computeMinMax)
1166    {
1167        osg::notify(osg::NOTICE)<<"Min value "<<minValue<<std::endl;
1168        osg::notify(osg::NOTICE)<<"Max value "<<maxValue<<std::endl;
1169
1170        float minComponent = minValue[0];
1171        minComponent = osg::minimum(minComponent,minValue[1]);
1172        minComponent = osg::minimum(minComponent,minValue[2]);
1173        minComponent = osg::minimum(minComponent,minValue[3]);
1174
1175        float maxComponent = maxValue[0];
1176        maxComponent = osg::maximum(maxComponent,maxValue[1]);
1177        maxComponent = osg::maximum(maxComponent,maxValue[2]);
1178        maxComponent = osg::maximum(maxComponent,maxValue[3]);
1179
1180
1181        switch(rescaleOperation)
1182        {
1183            case(NO_RESCALE):
1184                break;
1185
1186            case(RESCALE_TO_ZERO_TO_ONE_RANGE):
1187            {
1188                float scale = 0.99f/(maxComponent-minComponent);
1189                float offset = -minComponent * scale;
1190
1191                for(Images::iterator itr = images.begin();
1192                    itr != images.end();
1193                    ++itr)
1194                {       
1195                    osg::offsetAndScaleImage(itr->get(),
1196                        osg::Vec4(offset, offset, offset, offset),
1197                        osg::Vec4(scale, scale, scale, scale));
1198                }
1199                break;
1200            }
1201            case(SHIFT_MIN_TO_ZERO):
1202            {
1203                float offset = -minComponent;
1204
1205                for(Images::iterator itr = images.begin();
1206                    itr != images.end();
1207                    ++itr)
1208                {       
1209                    osg::offsetAndScaleImage(itr->get(),
1210                        osg::Vec4(offset, offset, offset, offset),
1211                        osg::Vec4(1.0f, 1.0f, 1.0f, 1.0f));
1212                }
1213                break;
1214            }
1215        };
1216
1217    }
1218
1219   
1220    if (colourSpaceOperation!=NO_COLOUR_SPACE_OPERATION)
1221    {
1222        for(Images::iterator itr = images.begin();
1223            itr != images.end();
1224            ++itr)
1225        {       
1226            (*itr) = doColourSpaceConversion(colourSpaceOperation, itr->get(), colourModulate);
1227        }
1228    }
1229   
1230    if (!gpuTransferFunction && transferFunction.valid())
1231    {
1232        for(Images::iterator itr = images.begin();
1233            itr != images.end();
1234            ++itr)
1235        {       
1236            *itr = osgVolume::applyTransferFunction(itr->get(), transferFunction.get());
1237        }
1238    }
1239   
1240    osg::ref_ptr<osg::Image> image_3d = 0;
1241
1242    if (images.size()==1)
1243    {
1244        osg::notify(osg::NOTICE)<<"Single image "<<images.size()<<" volumes."<<std::endl;
1245        image_3d = images.front();
1246    }
1247    else
1248    {
1249        osg::notify(osg::NOTICE)<<"Creating sequence of "<<images.size()<<" volumes."<<std::endl;
1250   
1251        osg::ref_ptr<osg::ImageSequence> imageSequence = new osg::ImageSequence;
1252        imageSequence->setLength(10.0);
1253        image_3d = imageSequence.get();
1254        for(Images::iterator itr = images.begin();
1255            itr != images.end();
1256            ++itr)
1257        {       
1258            imageSequence->addImage(itr->get());
1259        }
1260        imageSequence->play();
1261    }
1262   
1263    osg::ref_ptr<osgVolume::Volume> volume = new osgVolume::Volume;
1264    osg::ref_ptr<osgVolume::VolumeTile> tile = new osgVolume::VolumeTile;
1265    volume->addChild(tile.get());
1266
1267    osg::ref_ptr<osgVolume::Layer> layer = new osgVolume::ImageLayer(image_3d.get());
1268
1269    if (matrix)
1270    {
1271        osgVolume::Locator* locator = new osgVolume::Locator(*matrix);
1272        layer->setLocator(locator);
1273        tile->setLocator(locator);
1274    }
1275
1276    tile->setLayer(layer.get());
1277
1278    tile->setEventCallback(new osgVolume::PropertyAdjustmentCallback());
1279
1280    if (useShader)
1281    {
1282
1283        osgVolume::SwitchProperty* sp = new osgVolume::SwitchProperty;
1284        sp->setActiveProperty(0);
1285
1286        osgVolume::AlphaFuncProperty* ap = new osgVolume::AlphaFuncProperty(alphaFunc);
1287        osgVolume::SampleDensityProperty* sd = new osgVolume::SampleDensityProperty(0.005);
1288        osgVolume::TransparencyProperty* tp = new osgVolume::TransparencyProperty(1.0);
1289        osgVolume::TransferFunctionProperty* tfp = transferFunction.valid() ? new osgVolume::TransferFunctionProperty(transferFunction.get()) : 0;
1290
1291        {
1292            // Standard
1293            osgVolume::CompositeProperty* cp = new osgVolume::CompositeProperty;
1294            cp->addProperty(ap);
1295            cp->addProperty(sd);
1296            cp->addProperty(tp);
1297            if (tfp) cp->addProperty(tfp);
1298
1299            sp->addProperty(cp);
1300        }
1301
1302        {
1303            // Light
1304            osgVolume::CompositeProperty* cp = new osgVolume::CompositeProperty;
1305            cp->addProperty(ap);
1306            cp->addProperty(sd);
1307            cp->addProperty(tp);
1308            cp->addProperty(new osgVolume::LightingProperty);
1309            if (tfp) cp->addProperty(tfp);
1310
1311            sp->addProperty(cp);
1312        }
1313
1314        {
1315            // Isosurface
1316            osgVolume::CompositeProperty* cp = new osgVolume::CompositeProperty;
1317            cp->addProperty(sd);
1318            cp->addProperty(tp);
1319            cp->addProperty(new osgVolume::IsoSurfaceProperty(alphaFunc));
1320            if (tfp) cp->addProperty(tfp);
1321
1322            sp->addProperty(cp);
1323        }
1324
1325        {
1326            // MaximumIntensityProjection
1327            osgVolume::CompositeProperty* cp = new osgVolume::CompositeProperty;
1328            cp->addProperty(ap);
1329            cp->addProperty(sd);
1330            cp->addProperty(tp);
1331            cp->addProperty(new osgVolume::MaximumIntensityProjectionProperty);
1332            if (tfp) cp->addProperty(tfp);
1333
1334            sp->addProperty(cp);
1335        }
1336
1337        switch(shadingModel)
1338        {
1339            case(Standard):                     sp->setActiveProperty(0); break;
1340            case(Light):                        sp->setActiveProperty(1); break;
1341            case(Isosurface):                   sp->setActiveProperty(2); break;
1342            case(MaximumIntensityProjection):   sp->setActiveProperty(3); break;
1343        }
1344        layer->addProperty(sp);
1345
1346
1347        tile->setVolumeTechnique(new osgVolume::RayTracedTechnique);
1348    }
1349    else
1350    {
1351        layer->addProperty(new osgVolume::AlphaFuncProperty(alphaFunc));
1352        tile->setVolumeTechnique(new osgVolume::FixedFunctionTechnique);
1353    }
1354       
1355    if (!outputFile.empty())
1356    {   
1357        std::string ext = osgDB::getFileExtension(outputFile);
1358        std::string name_no_ext = osgDB::getNameLessExtension(outputFile);
1359        if (ext=="osg")
1360        {
1361            if (image_3d.valid())
1362            {
1363                image_3d->setFileName(name_no_ext + ".dds");           
1364                osgDB::writeImageFile(*image_3d, image_3d->getFileName());
1365            }
1366            osgDB::writeNodeFile(*volume, outputFile);
1367        }
1368        else if (ext=="ive")
1369        {
1370            osgDB::writeNodeFile(*volume, outputFile);       
1371        }
1372        else if (ext=="dds")
1373        {
1374            osgDB::writeImageFile(*image_3d, outputFile);
1375        }
1376        else
1377        {
1378            std::cout<<"Extension not support for file output, not file written."<<std::endl;
1379        }
1380       
1381        return 0;
1382    }
1383
1384
1385    if (volume.valid())
1386    {
1387
1388        // set the scene to render
1389        viewer.setSceneData(volume.get());
1390       
1391        // the the viewers main frame loop
1392        viewer.run();
1393    }   
1394   
1395    return 0;
1396
1397}
Note: See TracBrowser for help on using the browser.